BB2485 Metabolic Engineering 7,5 hp

• Metaboliska vägar för production av organiska syror, aminosyror, alkoholer, monomerer och polymerer.
• De underliggande koncepten bakom hur dessa metaboliska vägar balanseras, baserat på elementar-, redox- och energibalans.
• Strategier för metabolic engineering.
• Metabolisk fluxanalys.
• Metabolic control analysis
• Koncepten bakom stökiomtriska modeller av metabolism på genomskalenivå och deras användning för design av strategier för metabolic engineering.
• Användning av av termodynamiska begränsningar inom genomskalemodellering.
• De senaste framstegen inom genomskalemodellering, där stökiometri kombineras med proteomik och metabolomik.

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

• Kvantitativt beskriva metaboliska vägar för produktion av industriellt intressanta bränslen och kemikalier som diskuteras i kursen.
• Karakterisera de ovan nämnda metaboliska vägarna med avseende på elementar-, redox- och energibalans, diskutera de krav dessa ställer vid metabolic engineering, samt föreslå relevanta strategier för att uppfylla dessa krav.
• Konstruera och lösa matematiska representationer av metaboliska nätverka, baserat på tillhandahållna mätdata.
• Implementera genomskalemodellering av metabolismen för att designa och utvärdera strategier för metabolic engineering.

Avklarat examensarbete 15hp, 15 hp matematik, 5 hp numeriska metoder eller data, 30 hp kemi där även kurs i kemisk mätteknik kan ingå samt 20 hp bioteknik, biokemi eller molekylärbiologi. Engelska B/6.

• BB1230 Biokemi 2
• B1300 Odlingsteknologi
• KD1500 Fysikalisk biokemi

När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.

• PRO1 - Uppgift inom metabolisk modellering, 2,5 hp, betygsskala: P, F
• TEN1 - Skriftlig tentamen, 5,0 hp, betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F

Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.

Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.

Som del i PRO1 krävs fullföljande av alla övningar, aktivt deltagande i projektarbetet och slutpresentationen under projektseminariet.

Completion of all exercies is required as a part of PRO1, in addition to active participation in the project and the project preentation at the final seminar.

Antonius Van Maris

• Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
• Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
• Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.