Rubriker markerade med en asterisk ( * ) kommer från kursplan version VT 2023
Innehåll och lärandemål
Kursinnehåll
Alla levande organismer kräver energi, men möjligheten att erhålla energi varierar. Denna process kallas ämnesomsättning och ger både biologiska byggstenar och energi. Denna kurs behandlar huvudsakligen nedbrytande processer av kolhydrater för energiutvinning samt de centrala biomolekylerna och dess byggstenar aminosyror, lipider och kolhydrater.
Kursens huvudsakliga innehåll:
Rita kemiska strukturer, funktionella grupper, isomeri och olika typer av bindningar
Biologiska byggstenar; aminosyror, nukleotider, kolhydrater och lipider
Proteiners uppbyggnad, struktur och funktion
Enzymers aktivitet, katalytiska strategier och roll i metabolismen
Kolhydraters struktur, isomeri och uppbyggnad från mono- till polysackarider
Olika typer av lipider och uppbyggnad av biologiska membraner
Transport över membran
Kolhydratnedbrytande metabolism från glykolys till oxidativ fosforylering
Energiförändringar och elektronöverföringar i metabolismen
Utförande av ett laborationsmoment samt sammanställning av en laborationsrapport
Riskanalys av laborationens ingående kemikaliers miljöpåverkan samt värdering av hur dessa bör hanteras på laboratoriet
Lärandemål
Efter godkänd kurs (betyg E) skall studenten uppvisa
Kunskap och förståelse genom att kunna:
Beskriva och förklara grundläggande biokemiska begrepp.
Beskriva olika biomolekylers kemiska namn, funktion och kemiska struktur.
Tillämpa vanliga metoder inom biokemisk laborationsteknik.
Färdigheter och förmågor genom att kunna:
Sammanfatta de utförda laborationerna i en rapport.
För högre betyg (A-D) ska studenten även uppvisa
Kunskap och förståelse genom att kunna:
Använda och kombinera sina kunskaper inom biokemi för att förklara komplexa biokemiska frågeställningar.
Läraktiviteter
Föreläsningar/Workshoppar
Under kursen ges totalt 12 föreläsningar som täcker in det mesta av kursens teoretiska innehåll. De flesta föreläsningarna består av förinspelade videos som man tittar på innan varje schemalagt tillfälle och lämnar in en reflektionsuppgift. De flesta schemalagda föreläsningarna är workshoppar där vi jobbar med materialet från filmerna och diskuterar frågor och detta kräver att man har tittat på föreläsningen på egen hand innan den schemalagda workshopen.
Reflektionsuppgifter
Innan varje schemalagd workshop tittar man på det inspelade materialet på egen hand och lämnar in en individuell reflektionsuppgift enligt deadline på Canvas. Vissa föreläsningar kan ta upp till två timmar att titta igenom.
Övningar
Kursen innehåller sex stycken schemalagda övningar i halvklass i sal där vi arbetar med frågor kopplade till det teoretiska materialet. Det är mycket bra att ha en egen molekylbyggsats för att övningarna ska bli effektiva. På den andra halvan av kursen använder vi quiz i bokens lärplattform Achieve. Dessa quiz fungerar som fyra ytterligare övningar på kursen som man gör på egen hand.
Kontrollskrivning
Kursen innehåller en schemalagd kontrollskrivning efter halva kursen. Den görs digitalt i datasal och omfattar innehållet på föreläsningarna 1-6 samt övningarna 1-5. Kontrollskrivningen är obligatorisk och ingår i kursens examination. Man måste ha 50% av poängen på kontrollskrivningen för att få godkänt. Muntlig omexamination med examinatorerna erbjuds vid underkänt resultat.
Laborationer
Kursen innehåller två laborationer som examineras via en laborationsrapport. Här ingår att göra en riskanalys, beskriva hur olika kemikalier hanteras på laboratoriet samt hur avfall som uppstår skall hanteras. Efter avslutat laborationsmoment skrivs en laborationsrapport tillsammans med din laborationsgrupp.
Detaljplanering
Läraktivitet
Innehåll
Förberedelse
Föreläsning 1
Kursintroduktion
Boken kapitel 1, kurs PM
Övning 1
Kemisk bindning, kemisk struktur och funktionella grupper
Boken Chemistry Review Appendix: sid 1002-A4
Föreläsning 2
Aminosyror och proteinstruktur
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 2
Övning 2
Aminosyror och peptider
Föreläsning 2
Föreläsning 3
Enzymer
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 5 (ej sid 166-168 The different types of reversible inhibitors are kinetically distinguishable)
Föreläsning 4
Enzymers katalytiska strategier
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 6 (ej 6.4 & 6.5) och 15.4
Övning 3
Nyckelreaktioner och koenzymer i metabolismen
Föreläsning 3 & 4
Föreläsning 5
Lipider och biologiska membran
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 12
Övning 4
Lipider
Föreläsning 5
Föreläsning 6
Kolhydrater
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 11 (ej sid 340-348)
Övning 5
Kolhydrater
Föreläsning 6
Föreläsning 7
Membraners kanaler, pumpar och bärare
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 13 (ej 13.4 & 13.5, men läs sid 395-398 angående K+-kanalens jonselektivitet, text plus bilder 13.19-13.23)
Föreläsning 8
Metabolism-introduktion & glykolysen
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 15-15.3 & 16-16.3
Föreläsning 9
Glukoneogenesen & glykogennedbrytning
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 16.4-16.5 & 21-21.4
Föreläsning 10
Citronsyracykeln
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 17-17.5 (ej sid 518-521 Mechanism: The synthesis of acetyl coenzyme A from pyruvate requires ...)
Föreläsning 11
Elektrontransportkedjan
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 18
Föreläsning 12
ATP syntes & kursavslut
Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 18
Övning 10
Komplexa biokemiska uppgifter
Föreläsningar 8-12
Kursens pedagogiska upplägg (Samla poäng till tentan)
På denna kurs använder vi ett effektivt lärande som delvis examineras kontiuerligt genom att man kan samla poäng under kursens gång på tre olika sätt:
Inför varje schemalagd föreläsningsworkshop förbereder man sig själv genom att titta igenom det förinspelade materialet och lämna in en reflektionsuppgift. En förinspelad föreläsning tar ibland upp till 2 timmar att titta igenom. Detta material kommer inte att gås igenom igen utan när vi ses på det schemalagda workshop-tillfället så jobbar vi istället med materialet och du behöver bidra aktivt med dina frågor och reflektioner. Varje inlämnad reflektion i tid enligt varje deadline som beskrivs i Canvas ger 0,2 poäng. Detta kan ge 2,2 poäng.
Aktivt deltagande på kursens sex schemalagda övningar samt slutförande av de fyra quiz-övningarna på andra halvan av kursen ger 0,2 poäng per övning. Detta kan ge 2,0 poäng.
Resultatet på den obligatoriska kontrollskrivningen ger poäng. Detta kan ge max 3,0 poäng.
Man kan alltså samla ihop totalt 7,2 poäng till tentan under kursens gång.
Förberedelser inför kursstart
Kurslitteratur
Kursbok: Biochemistry, 10:eutgåvan (2023), Berg, Gatto Jr., Hines, Tymoczko, och Stryer. Boken är gratis som e-bok för alla kursregistrerade studenter. Den kan ocksåköpas på Kårbokhandeln för den som vill ha en bok i pappersform. Övrig litteratur och material till kursen finns tillgängligt i lärplattformen Canvas.
Vi använder Achieve på denna kurs. Achieve är en lärplattform från bokförlaget MacMillan där man kan göra quiz, träna på övningsfrågor och få tips på vilka avsnitt man bör läsa i boken. På första föreläsningen går vi igenom hur man skapar sitt konto på Achieve.
Utrustning
Molekylmodellbyggsats: Vid flera av övningstillfällena kommer vi att bygga biomolekyler med hjälp av en molekylmodellbyggsats (för organisk kemi/biokemi). Ett visst antal molekylmodellbyggsatser kommer finnas tillgängliga på de schemalagda övningarna att låna. En molekylmodellbyggsats är användbar under hela utbildningen och vi rekommenderar starkt att man köper en egen byggsats och tar med den till övningstillfällena. Det finns många olika typer men en låda för organisk kemi fungerar bra. På Kårbokhandeln på KTH finns en bra variant. Byggsatsen kan man också använda på kurserna i organisk kemi och man får ta med sin egen molekylbyggsatslåda till tentan i biokemi 1.
Stöd för studenter med funktionsnedsättning
Om du har en funktionsnedsättning kan du få stöd via Funka:
TENA - Skriftlig tentamen, 6,5 hp, Betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F
Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.
Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.
Avsnittet nedan kommer inte från kursplanen:
Laboration ( LABA )
Det laborativa momentet består av 2 laborationer samt 3 övningstillfällen. Laborationsmomentet gås igenom vid 2 övningstillfällen i halvklass där laborationsrutiner, riskanalys, kemikaliers miljöpåverkan, avfallshantering samt rapportskrivning gås igenom. Efter laboration 2 ska en laborationsrapport skrivas. Denna kommer initialt att kamraträttas vid ett tredje övningstillfälle för att ge möjlighet till återkoppling innan inlämning. Labrapporten ligger till grund för examination av det laborativa momentet. Mer information om laborationsmomentet finns i Laborationskompendiet.
Skriftlig tentamen ( TENA )
Teoridelen examineras på en skriftlig salstentamen (TENA) i datasal. Enda tillåtna hjälpmedel är molekylmodellbyggsatsen som du får ta med dig om du vill. Tentan består både av quiz-frågor på dator och frågor som besvaras på papper. På tentan finns frågor för betyget E och andra frågor för betygen A-D. Frågorna för betyg E är av mer grundläggande karaktär och täcker basala begrepp inom kursen. Frågorna för betygen A-D bygger mer på detaljkunskap, förståelse, sammanlänkning av moment och värdering av biokemiska begrepp. E-betygsfrågorna utgör 30 p och frågorna för högre betyg ytterligare 30 p. Kontrollskrivningen i mitten av kursen är obligatorisk och ingår i den skriftliga examinationen.
Möjlighet att samla poäng
Extra poäng under kursen kan erhållas på tre sätt. (1) Den obligatoriska kontrollskrivningen på grundläggande begrepp ger möjlighet att få upp till tre poäng. (2) Som förberedelse till varje föreläsnings-workshop inlämnas en reflektionsuppgift i Canvas. Detta ger totalt 2,2 poäng. (3) Aktivt deltagande på övningarna ger totalt 2 poäng. Dessa poäng (totalt max 7,2 poäng) adderas till ditt resultat på den skriftliga tentan och kan bidra till att du klarar E-betyget eller kan göra att tentabetyget höjs ett steg.
Övriga krav för slutbetyg
För godkänt i kursen krävs godkänd tentamen (TENA) och godkänd laborationskurs (LABA)
Möjlighet till komplettering
Möjlighet till muntlig komplettering till betyget E erbjuds de studenter som får betyget Fx på examinationen.
Möjlighet till plussning
Det finns möjlighet för plussning på denna kurs. Detta görs genom att anmäla sig och delta i den skriftliga tentan vid ett nytt tentatillfälle. För anmälan krävs kontakt med studentsupport innan den ordinarie anmälningstiden har gått ut.
Etiskt förhållningssätt
Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.
Det enklaste är att mejla administratörerna på studentsupport@cbh.kth.se om du har frågor och behöver hjälp med registrering, anmälan till tenta, anmälan till kontrollskrivning eller har andra administrativa frågor.
Det enklaste är att mejla administratörerna på studentsupport@cbh.kth.se om du har frågor och behöver hjälp med registrering, anmälan till tenta, anmälan till kontrollskrivning eller har andra administrativa frågor.